5GM6

Cryo-EM structure of the activated spliceosome (Bact complex) at 3.5 angstrom resolution

WebGL does not seem to be available.

This can be caused by an outdated browser, graphics card driver issue, or bad weather. Sometimes, just restarting the browser helps. Also, make sure hardware acceleration is enabled in your browser.

For a list of supported browsers, refer to http://caniuse.com/#feat=webgl.

Sequence of
127  ​A​​Y​​T​​P​​K​​A​​E​​M​​P​​P​137  ​E​​H​​L​​R​​K​​I​​I​​N​​T​​H​147  ​S​​D​​M​​A​​S​​K​​M​​Y​​N​​T​157  ​D​​K​​K​​A​​F​​L​​G​​A​​L​​K​167  ​Y​​L​​P​​H​​A​​I​​L​​K​​L​​L​177  ​E​​N​​M​​P​​H​​P​​W​​E​​Q​​A​187  ​K​​E​​V​​K​​V​​L​​Y​​H​​T​​S​197  ​G​​A​​I​​T​​F​​V​​N​​E​​T​​P​207  ​R​​V​​I​​E​​P​​V​​Y​​T​​A​​Q​217  ​W​​S​​A​​T​​W​​I​​A​​M​​R​​R​227  ​E​​K​​R​​D​​R​​T​​H​​F​​K​​R​237  ​M​​R​​F​​P​​P​​F​​D​​D​​D​​E​247  ​P​​P​​L​​S​​Y​​E​​Q​​H​​I​​E​257  ​N​​I​​E​​P​​L​​D​​P​​I​​N​​L​267  ​P​​L​​D​​S​​Q​​D​​D​​E​​Y​​V​277  ​K​​D​​W​​L​​Y​​D​​S​​R​​P​​L​287  ​E​​E​​D​​S​​K​​K​​V​​N​​G​​T​297  ​S​​Y​​K​​K​​W​​S​​F​​D​​L​​P​307  ​E​​M​​S​​N​​L​​Y​​R​​L​​S​​T​317  ​P​​L​​R​​D​​E​​V​​T​​D​​K​​N​327  ​Y​​Y​​Y​​L​​F​​D​​K​​K​​S​​F​337  ​F​​N​​G​​K​​A​​L​​N​​N​​A​​I​347  ​P​​G​​G​​P​​K​​F​​E​​P​​L​​Y​357  ​P​​R​​E​​E​​E​​E​​D​​Y​​N​​E​367  ​F​​N​​S​​I​​D​​R​​V​​I​​F​​R​377  ​V​​P​​I​​R​​S​​E​​Y​​K​​V​​A​387  ​F​​P​​H​​L​​Y​​N​​S​​R​​P​​R​397  ​S​​V​​R​​I​​P​​W​​Y​​N​​N​​P​407  ​V​​S​​C​​I​​I​​Q​​N​​D​​E​​E​417  ​Y​​D​​T​​P​​A​​L​​F​​F​​D​​P​427  ​S​​L​​N​​P​​I​​P​​H​​F​​I​​D​     ​N​​N​​S​​S​​L​​N​​V​​S​​N​​T​     ​K​​E​​N​​G​​D​​F​​T​​L​​P​​E​457  ​D​​F​​A​​P​​L​​L​​A​​E​​E​​E​467  ​E​​L​​I​​L​​P​​N​​T​​K​​D​​A​477  ​M​​S​​L​​Y​​H​​S​​P​​F​​P​​F​487  ​N​​R​​T​​K​​G​​K​​M​​V​​R​​A​497  ​Q​​D​​V​​A​​L​​A​​K​​K​​W​​F​507  ​L​​Q​​H​​P​​D​​E​​E​​Y​​P​​V​517  ​K​​V​​K​​V​​S​​Y​​Q​​K​​L​​L​527  ​K​​N​​Y​​V​​L​​N​​E​​L​​H​​P​537  ​T​​L​​P​​T​​N​​H​​N​​K​​T​​K​547  ​L​​L​​K​​S​​L​​K​​N​​T​​K​​Y​557  ​F​​Q​​Q​​T​​T​​I​​D​​W​​V​​E​567  ​A​​G​​L​​Q​​L​​C​​R​​Q​​G​​H​577  ​N​​M​​L​​N​​L​​L​​I​​H​​R​​K​587  ​G​​L​​T​​Y​​L​​H​​L​​D​​Y​​N​597  ​F​​N​​L​​K​​P​​T​​K​​T​​L​​T​607  ​T​​K​​E​​R​​K​​K​​S​​R​​L​​G​617  ​N​​S​​F​​H​​L​​M​​R​​E​​L​​L​627  ​K​​M​​M​​K​​L​​I​​V​​D​​T​​H​637  ​V​​Q​​F​​R​​L​​G​​N​​V​​D​​A​647  ​F​​Q​​L​​A​​D​​G​​I​​H​​Y​​I​657  ​L​​N​​H​​I​​G​​Q​​L​​T​​G​​I​667  ​Y​​R​​Y​​K​​Y​​K​​V​​M​​H​​Q​677  ​I​​R​​A​​C​​K​​D​​L​​K​​H​​I​687  ​I​​Y​​Y​​K​​F​​N​​K​​N​​L​​G​697  ​K​​G​​P​​G​​C​​G​​F​​W​​Q​​P​707  ​A​​W​​R​​V​​W​​L​​N​​F​​L​​R​717  ​G​​T​​I​​P​​L​​L​​E​​R​​Y​​I​727  ​G​​N​​L​​I​​T​​R​​Q​​F​​E​​G​737  ​R​​S​​N​​E​​I​​V​​K​​T​​T​​T​747  ​K​​Q​​R​​L​​D​​A​​Y​​Y​​D​​L​757  ​E​​L​​R​​N​​S​​V​​M​​D​​D​​I​767  ​L​​E​​M​​M​​P​​E​​S​​I​​R​​Q​777  ​K​​K​​A​​R​​T​​I​​L​​Q​​H​​L​787  ​S​​E​​A​​W​​R​​C​​W​​K​​A​​N​797  ​I​​P​​W​​D​​V​​P​​G​​M​​P​​A​807  ​P​​I​​K​​K​​I​​I​​E​​R​​Y​​I​817  ​K​​S​​K​​A​​D​​A​​W​​V​​S​​A​827  ​A​​H​​Y​​N​​R​​E​​R​​I​​K​​R​837  ​G​​A​​H​​V​​E​​K​​T​​M​​V​​K​847  ​K​​N​​L​​G​​R​​L​​T​​R​​L​​W​857  ​I​​K​​N​​E​​Q​​E​​R​​Q​​R​​Q​867  ​I​​Q​​K​​N​​G​​P​​E​​I​​T​​P​877  ​E​​E​​A​​T​​T​​I​​F​​S​​V​​M​887  ​V​​E​​W​​L​​E​​S​​R​​S​​F​​S​897  ​P​​I​​P​​F​​P​​P​​L​​T​​Y​​K​907  ​N​​D​​T​​K​​I​​L​​V​​L​​A​​L​917  ​E​​D​​L​​K​​D​​V​​Y​​A​​S​​K​927  ​V​​R​​L​​N​​A​​S​​E​​R​​E​​E​937  ​L​​A​​L​​I​​E​​E​​A​​Y​​D​​N​947  ​P​​H​​D​​T​​L​​N​​R​​I​​K​​K​957  ​Y​​L​​L​​T​​Q​​R​​V​​F​​K​​P​967  ​V​​D​​I​​T​​M​​M​​E​​N​​Y​​Q​977  ​N​​I​​S​​P​​V​​Y​​S​​V​​D​​P​987  ​L​​E​​K​​I​​T​​D​​A​​Y​​L​​D​997  ​Q​​Y​​L​​W​​Y​​E​​A​​D​​Q​​R​1007 ​K​​L​​F​​P​​N​​W​​I​​K​​P​​S​1017 ​D​​S​​E​​I​​P​​P​​L​​L​​V​​Y​1027 ​K​​W​​T​​Q​​G​​I​​N​​N​​L​​S​1037 ​E​​I​​W​​D​​V​​S​​R​​G​​Q​​S​1047 ​A​​V​​L​​L​​E​​T​​T​​L​​G​​E​1057 ​M​​A​​E​​K​​I​​D​​F​​T​​L​​L​1067 ​N​​R​​L​​L​​R​​L​​I​​V​​D​​P​1077 ​N​​I​​A​​D​​Y​​I​​T​​A​​K​​N​1087 ​N​​V​​V​​I​​N​​F​​K​​D​​M​​S​1097 ​H​​V​​N​​K​​Y​​G​​L​​I​​R​​G​1107 ​L​​K​​F​​A​​S​​F​​I​​F​​Q​​Y​1117 ​Y​​G​​L​​V​​I​​D​​L​​L​​L​​L​1127 ​G​​Q​​E​​R​​A​​T​​D​​L​​A​​G​1137 ​P​​A​​N​​N​​P​​N​​E​​F​​M​​Q​1147 ​F​​K​​S​​K​​E​​V​​E​​K​​A​​H​1157 ​P​​I​​R​​L​​Y​​T​​R​​Y​​L​​D​1167 ​R​​I​​Y​​M​​L​​F​​H​​F​​E​​E​1177 ​D​​E​​G​​E​​E​​L​​T​​D​​E​​Y​1187 ​L​​A​​E​​N​​P​​D​​P​​N​​F​​E​1197 ​N​​S​​I​​G​​Y​​N​​N​​R​​K​​C​1207 ​W​​P​​K​​D​​S​​R​​M​​R​​L​​I​1217 ​R​​Q​​D​​V​​N​​L​​G​​R​​A​​V​1227 ​F​​W​​E​​I​​Q​​S​​R​​V​​P​​T​1237 ​S​​L​​T​​S​​I​​K​​W​​E​​N​​A​1247 ​F​​V​​S​​V​​Y​​S​​K​​N​​N​​P​1257 ​N​​L​​L​​F​​S​​M​​C​​G​​F​​E​1267 ​V​​R​​I​​L​​P​​R​​Q​​R​​M​​E​1277 ​E​​V​​V​​S​​N​​D​​E​​G​​V​​W​1287 ​D​​L​​V​​D​​E​​R​​T​​K​​Q​​R​1297 ​T​​A​​K​​A​​Y​​L​​K​​V​​S​​E​1307 ​E​​E​​I​​K​​K​​F​​D​​S​​R​​I​1317 ​R​​G​​I​​L​​M​​A​​S​​G​​S​​T​1327 ​T​​F​​T​​K​​V​​A​​A​​K​​W​​N​1337 ​T​​S​​L​​I​​S​​L​​F​​T​​Y​​F​1347 ​R​​E​​A​​I​​V​​A​​T​​E​​P​​L​1357 ​L​​D​​I​​L​​V​​K​​G​​E​​T​​R​1367 ​I​​Q​​N​​R​​V​​K​​L​​G​​L​​N​1377 ​S​​K​​M​​P​​T​​R​​F​​P​​P​​A​1387 ​V​​F​​Y​​T​​P​​K​​E​​L​​G​​G​1397 ​L​​G​​M​​I​​S​​A​​S​​H​​I​​L​1407 ​I​​P​​A​​S​​D​​L​​S​​W​​S​​K​1417 ​Q​​T​​D​​T​​G​​I​​T​​H​​F​​R​1427 ​A​​G​​M​​T​​H​​E​​D​​E​​K​​L​1437 ​I​​P​​T​​I​​F​​R​​Y​​I​​T​​T​1447 ​W​​E​​N​​E​​F​​L​​D​​S​​Q​​R​1457 ​V​​W​​A​​E​​Y​​A​​T​​K​​R​​Q​1467 ​E​​A​​I​​Q​​Q​​N​​R​​R​​L​​A​1477 ​F​​E​​E​​L​​E​​G​​S​​W​​D​​R​1487 ​G​​I​​P​​R​​I​​S​​T​​L​​F​​Q​1497 ​R​​D​​R​​H​​T​​L​​A​​Y​​D​​R​1507 ​G​​H​​R​​I​​R​​R​​E​​F​​K​​Q​1517 ​Y​​S​​L​​E​​R​​N​​S​​P​​F​​W​1527 ​W​​T​​N​​S​​H​​H​​D​​G​​K​​L​1537 ​W​​N​​L​​N​​A​​Y​​R​​T​​D​​V​1547 ​I​​Q​​A​​L​​G​​G​​I​​E​​T​​I​1557 ​L​​E​​H​​T​​L​​F​​K​​G​​T​​G​1567 ​F​​N​​S​​W​​E​​G​​L​​F​​W​​E​1577 ​K​​A​​S​​G​​F​​E​​D​​S​​M​​Q​1587 ​F​​K​​K​​L​​T​​H​​A​​Q​​R​​T​1597 ​G​​L​​S​​Q​​I​​P​​N​​R​​R​​F​1607 ​T​​L​​W​​W​​S​​P​​T​​I​​N​​R​1617 ​A​​N​​V​​Y​​V​​G​​F​​L​​V​​Q​1627 ​L​​D​​L​​T​​G​​I​​F​​L​​H​​G​1637 ​K​​I​​P​​T​​L​​K​​I​​S​​L​​I​1647 ​Q​​I​​F​​R​​A​​H​​L​​W​​Q​​K​1657 ​I​​H​​E​​S​​I​​V​​F​​D​​I​​C​1667 ​Q​​I​​L​​D​​G​​E​​L​​D​​V​​L​1677 ​Q​​I​​E​​S​​V​​T​​K​​E​​T​​V​1687 ​H​​P​​R​​K​​S​​Y​​K​​M​​N​​S​1697 ​S​​A​​A​​D​​I​​T​​M​​E​​S​​V​1707 ​H​​E​​W​​E​​V​​S​​K​​P​​S​​L​1717 ​L​​H​​E​​T​​N​​D​​S​​F​​K​​G​1727 ​L​​I​​T​​N​​K​​M​​W​​F​​D​​V​1737 ​Q​​L​​R​​Y​​G​​D​​Y​​D​​S​​H​1747 ​D​​I​​S​​R​​Y​​V​​R​​A​​K​​F​1757 ​L​​D​​Y​​T​​T​​D​​N​​V​​S​​M​1767 ​Y​​P​​S​​P​​T​​G​​V​​M​​I​​G​1777 ​I​​D​​L​​A​​Y​​N​​M​​Y​​D​​A​1787 ​Y​​G​​N​​W​​F​​N​​G​​L​​K​​P​1797 ​L​​I​​Q​​N​​S​​M​​R​​T​​I​​M​1807 ​K​​A​​N​​P​​A​​L​​Y​​V​​L​​R​1817 ​E​​R​​I​​R​​K​​G​​L​​Q​​I​​Y​1827 ​Q​​S​​S​​V​​Q​​E​​P​​F​​L​​N​1837 ​S​​S​​N​​Y​​A​​E​​L​​F​​N​​N​1847 ​D​​I​​K​​L​​F​​V​​D​​D​​T​​N​1857 ​V​​Y​​R​​V​​T​​V​​H​​K​​T​​F​1867 ​E​​G​​N​​V​​A​​T​​K​​A​​I​​N​1877 ​G​​C​​I​​F​​T​​L​​N​​P​​K​​T​1887 ​G​​H​​L​​F​​L​​K​​I​​I​​H​​T​1897 ​S​​V​​W​​A​​G​​Q​​K​​R​​L​​S​1907 ​Q​​L​​A​​K​​W​​K​​T​​A​​E​​E​1917 ​V​​S​​A​​L​​V​​R​​S​​L​​P​​K​1927 ​E​​E​​Q​​P​​K​​Q​​I​​I​​V​​T​1937 ​R​​K​​A​​M​​L​​D​​P​​L​​E​​V​1947 ​H​​M​​L​​D​​F​​P​​N​​I​​A​​I​1957 ​R​​P​​T​​E​​L​​R​​L​​P​​F​​S​1967 ​A​​A​​M​​S​​I​​D​​K​​L​​S​​D​1977 ​V​​V​​M​​K​​A​​T​​E​​P​​Q​​M​1987 ​V​​L​​F​​N​​I​​Y​​D​​D​​W​​L​1997 ​D​​R​​I​​S​​S​​Y​​T​​A​​F​​S​2007 ​R​​L​​T​​L​​L​​L​​R​​A​​L​​K​2017 ​T​​N​​E​​E​​S​​A​​K​​M​​I​​L​2027 ​L​​S​​D​​P​​T​​I​​T​​I​​K​​S​2037 ​Y​​H​​L​​W​​P​​S​​F​​T​​D​​E​2047 ​Q​​W​​I​​T​​I​​E​​S​​Q​​M​​R​2057 ​D​​L​​I​​L​​T​​E​​Y​​G​​R​​K​2067 ​Y​​N​​V​​N​​I​​S​​A​​L​​T​​Q​2077 ​T​​E​​I​​K​​D​​I​​I​​L​​G​​Q​     ​N​​I​​K​​A​​P​​S​​V​​K​​R​​Q​     ​K​​M​​A​​E​​L​​E​​A​​A​​R​​S​     ​E​​K​​Q​​N​​D​​E​​E​​A​​A​​G​     ​A​​S​​T​​V​​M​​K​​T​​K​​T​​I​     ​N​​A​​Q​​G​​E​​E​​I​​V​​V​​V​     ​A​​S​​A​​D​​Y​​E​​S​​Q​​T​​F​     ​S​​S​​K​​N​​E​​W​​R​​K​​S​​A​2157 ​I​​A​​N​​T​​L​​L​​Y​​L​​R​​L​2167 ​K​​N​​I​​Y​​V​​S​​A​​D​​D​​F​2177 ​V​​E​​E​​Q​​N​​V​​Y​​V​​L​​P​2187 ​K​​N​​L​​L​​K​​K​​F​​I​​E​​I​2197 ​S​​D​​V​​K​​I​​Q​​V​​A​​A​​F​2207 ​I​​Y​​G​​M​​S​​A​​K​​D​​H​​P​2217 ​K​​V​​K​​E​​I​​K​​T​​V​​V​​L​2227 ​V​​P​​Q​​L​​G​​H​​V​​G​​S​​V​2237 ​Q​​I​​S​​N​​I​​P​​D​​I​​G​​D​2247 ​L​​P​​D​​T​​E​​G​​L​​E​​L​​L​2257 ​G​​W​​I​​H​​T​​Q​​T​​E​​E​​L​2267 ​K​​F​​M​​A​​A​​S​​E​​V​​A​​T​2277 ​H​​S​​K​​L​​F​​A​​D​​K​​K​​R​2287 ​D​​C​​I​​D​​I​​S​​I​​F​​S​​T​2297 ​P​​G​​S​​V​​S​​L​​S​​A​​Y​​N​2307 ​L​​T​​D​​E​​G​​Y​​Q​​W​​G​​E​2317 ​E​​N​​K​​D​​I​​M​​N​​V​​L​​S​2327 ​E​​G​​F​​E​​P​​T​​F​​S​​T​​H​2337 ​A​​Q​​L​​L​​L​​S​​D​​R​​I​​T​2347 ​G​​N​​F​​I​​I​​P​​S​​G​​N​​V​2357 ​W​​N​​Y​​T​​F​​M​​G​​T​​A​​F​2367 ​N​​Q​​E​​G​​D​​Y​​N​​F​​K​​Y​2377 ​G​​I​​P​​L​​E​​F​​Y​​N​​E​​M​2387 ​H​​R​​P​​V​​H​​F​​L​​Q​​F​​S​     ​E​​L​​A​​G​​D​​E​​E​​L​​E​​A​2407 ​E​​Q​​I​​D​​V​​F​​S​
Type
Asm Id
Dynamic Bonds

Select a different viewer

Citation:

See Citation Policies for referencing Mol*, RCSB PDB, PDB structures, and Computed Structure Models.